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1999年1月12日下午，医学院召开全院大会。会上，校党委常务副书记贺建时宣读了对医学院副院长陈枢青的任命、并明确医学院行政领导班子已经就位，今后医学院建设领导小组不再参与医学院的日常工作。

1999年1月12日下午，医学院院长章锁江主持召开了办学思想研讨会，会议明确：（1）学院设立学科，但不设教研室；（2）教学和科研并行，基础要与临床结合；（3）重点实验室的装备共享，确定主攻方向；（4）信息为先，人才为贵。

1999年4月8日上午，医学院院长章锁江召开院务会议。会议确定学院内设置9个学科，审定了附属医院主任医师、副主任医师中担任临床教学工作的教授、副教授首批人员名单；审定了一批拟聘任客座教授和兼职教授名单。

1999年4月22日下午，赵安中先生、卢良宝先生、副市长盛昌黎、政协副主席陈守义，在校务委员会主任吴心平、副校长王伯康等陪同下，参观访问了宁波市第三医院。会议共同探讨了第三医院成为宁波大学医学院附属医院和将第三医院建成医学院医疗中心的可能性以及建设方案。

1999年年初，全国高等医学教育学会同意宁波大学医学院与暨南大学医学院共同在暨南大学医学院筹办工作的基础上联合承办“如何办好综合性大学医学院”的研讨会。

1999年5月6日上午，由美籍宁波同胞、美国路易斯安那州立大学医学院副教授乌蔚庭博士捐资助建的“张克玲生物化学实验室”举行揭碑仪式。

1999年5月17日上午，校党委副书记贺建时、组织部长徐茵到医学院宣布王玉婷同志任医学院党总支副书记，兼管日常行政事务和学生工作。

1999年5月中旬，名誉院长汤于翰博士所设计的图案最终被确定为医学院院标；同时确定以汤于翰博士提出的“博学守仁”为院训。

1999年6月6日上午，医学院成立一周年庆典暨学术报告会举行。学院顾问、原浙江医科大学院长郑树教授，学院顾问、上海医科大学校长姚泰教授；卫生部国家医学考试中心命题委员会资深专家、白求恩医科大学原教务长李春昌教授；浙江大学医学院基础医学研究所所长余应年教授；浙江大学药学院药剂学教研室主任梁文权教授等；市政协副主席、宁波市戒毒所所长杨国栋研究员；市卫生局、市医学会代表；宁波市各大医院院长；校领导张钧澄、曹屯裕、忻正大、王伯康出席会议。大会由校务委员会主任吴心平主持。会后，姚泰教授、郑树教授、李春昌教授、余应年教授等做了学术报告。

1999年8月18日，市长张蔚文来宁大视察，并察看了医学院至真楼，他高度赞扬了医学院的办学水平。

1999年8月26日，市委副书记、校党委书记徐福宁，市卫生局局长何一天到市第三医院视察并听取了王林龙院长的汇报。徐福宁副书记表示：办好宁波大学医学院一定要有好的附属医院，市三院是直属附属医院比较合适的对象，宁大和市第三医院双方应尽快协商。市第三医院从现在起就按附属医院的要求进行规划。

1999年8月30日，宁波大学与市第三医院就第三医院成为宁大医学院附属医院的有关问题进行协商讨论。双方商定联合向市政府书面报告请求将三院定为宁波大学直属附属医院，并开始筹划附属医院、医疗中心和医学研究所的发展规划与建设蓝图。

1999年9月，副校长王伯康、医学院院长章锁江应宁波——亚琛友好城市促进会德方主席B·H·Promper先生邀请，访问德国亚琛工业大学医学院及亚琛医院。

1999年10月20日，国家教育部副部长周远清来校听取了医学院院长章锁江的情况汇报，参观了至真楼的实验室，并督促要早日彻底解决附属医院问题。

1999年10月22日，余姚老方桥镇卫生院成为“宁波大学医学院全科医学教学基地”挂牌仪式举行。

1999年10月27日，根据甬政发〔1999〕219号文件，宁波市第三医院改制为宁波大学医学院附属医院，并且明确：改制后，保留宁波市第三医院院名；附属医院直属宁波大学医学院领导，市卫生局对其进行行业管理和业务指导；附属医院的卫生事业经费按原渠道拨给。

1999年12月6日，医学院第一次团员暨学生代表大会召开，共有38位代表参加。大会选举产生了医学院首届团总支委员会和学生会委员会。