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2001年3月29日，“宁波市医学分子诊断中心建设项目可行性论证会”在宁大医学院附属医院（市三院）举行。专家们建议把中心建成研究与服务并重，在国内外有一定影响的医、教、研一体化的医学分子研究机构。

2001年6月7日，省高校基础实验室评估专家组对医学院基础医学实验室进行评估。专家们认为医学院基础医学实验室管理有特色，布局合理，实验教学改革有初步的探索和实践，已达到合格标准。

2001年6月20日，“宁波大学医学院教学医院授牌仪式”在慈溪市人民医院举行。

2001年9月15日，首届浙江大学远程教育护理学开学仪式在浙江大学举行。医学院作为浙大远程教育护理学专升本宁波教学站，在宁波市录取了80多名卫生护理人员。

2001年10月，宁波大学医学院附属医院（市第三医院）晋升为三级乙等医院。

2001年10月28日至30日，泰国清迈大学代表团来校访问。医学院与泰国清迈大学医学院就促进学术领域的国际合作等达成了共识，执行院长章锁江教授与泰国清迈大学医学院院长Piya博士分别代表中泰双方在友好合作交流协议书上签字。

2001年12月27日，宁波市医学分子诊断中心正式成立大会暨授牌仪式在我校举行。中国科学院院长路甬祥院士，市委书记黄兴国，医学院倡议人和捐资者、名誉院长汤于翰博士，中国科学院院士陈中伟、吴孟超，浙江省教育厅等给宁波市医学分子诊断中心发来贺信；汤于翰博士伉俪向中心赠送礼金和贺匾。浙江省卫生厅副厅长陈晓非、中科院与省市合作领导协调委员会副主任竺玄、市政协副主席杨国栋、中国科学院院士陈凯先、中国科学院院士刘新垣等领导和嘉宾到会祝贺。仪式由常务副校长聂秋华主持。

2001年12月30日上午，中国科学院院士、全国政协常委韩启德教授参观了医学院，并为医学院题词“创建有我国特色的医学院”。