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2003年1月，新一届院领导班子成立：张龙禄为执行院长，卢美芬为党总支书记兼副院长，焦效兰为副院长，刘忠秀为党总支副书记，医学院附属医院王林龙院长兼任副院长。

2003年4月30日，根据宁大政办〔2003〕12号文件，宁波市医学科学研究所、宁波市医学分子诊断中心负责人名单及分工调整如下：洪国藩为所长、法定代表人、中心主任，王林龙为副所长、副主任，金之瑾为副所长、副主任，负责日常工作，毕东海为研究所及中心顾问。

2003年5月，浙江省学位委员会下达《关于同意浙江工业大学等八所高校的37个专业具有学士学位授予权的批复》（浙学位〔2003〕7号），医学院临床医学专业被批准具有学士学位授予权。

2003年6月16日，宁波大学医学院成立五周年大会暨首届医学生毕业典礼举行。市委副书记、校党委书记徐福宁，市人大常委会副主任陈继武，市政协副主席陈守义，市卫生局局长何一天，市教育局局长华长慧，学校党政领导等出席了仪式。

2003年，医学院外科学学科专业点获硕士学位授予权，硕士研究生招收工作从2004年开始。

2003年10月17日，宁波大学医学院教学医院的授牌仪式在温岭市第一人民医院举行。

2003年10月，经市卫生局和宁波大学批准同意，宁波市第一医院、宁波市妇女儿童医院成为医学院附属医院（非直属），并分别于10月16日、10月27日举行了授牌仪式。

2003年11月，学校发文（宁大政干〔2004〕2号），任命史波宁主任医师为医学院附属医院副院长。

2003年12月3日，国家教育部高教司刘凤泰副司长在校长严陆光院士、常务副校长聂秋华陪同下视察医学院，刘凤泰副司长在听取医学院汇报后，对医学院五年来确立“有特色、高水平、现代化”的办学目标，走“研究、改革、创新相结合”的办学道路所取得的成绩给予充分肯定，并对医学院今后发展提出殷切的期望。