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2006年5月28日，医学院举行预防医学专业论证会。

2006年6月30日上午，医学院召开全体党员大会，选举产生了新一届党总支委员会。委员有王国良、尹维刚、刘忠秀、陈莉霞、沈其君，书记由陈莉霞同志担任，副书记由刘忠秀同志担任。

2006年9月26日，医学院教工支部进行了改选，将原来的一个教工党支部拆分为三个。

2006年9月，宁波大学医学院附属泌尿肾病医院、鄞州第二医院落成开业。

2006年10月18日下午，医学院第三届教职工大会暨工会会员大会召开，选举产生了第三届分工会委员会，委员有张莉娜、王湖清、赵晶，分工会主席由张莉娜担任。

2006年11月10日上午，在浙江省疾病预防控制中心举行了“研究生培养基地”和“本科生教学基地”签约揭牌仪式。浙江省卫生厅副厅长杨泉森、副校长赵伐出席仪式并讲话。