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个人简介
本人的研究方向为:多尺度理论模拟方法(MD,QM/MM, QM/MM MD)研究酶催化反应机理,并进行理性改造;蛋白-蛋白相互作用,蛋白-小分子相互作用。
(1)采用多尺度理论模拟方法中的分子动力学(MD)模拟,对蛋白环境进行描述,通过长时间的MD模拟,获得稳定的蛋白构象,采用结合量子力学/分子力学(QM/MM)方法计算金属酶体系反应过程的机理和电子传递过程。
(2)采用QM/MM MD方法对酶催化反应过程进行动态描述。
(3)对酶,主要是P450和依赖a-酮戊二酸(a-KG)酶进行理性设计。将P450酶改造为依赖H2O2的酶,降低使用NAD(P)H还原剂的成本。调控a-KG酶羟基化反应路径。
(4)针对底物的C-H键活化,通过高通量筛选,选择适合的酶进行选择性羟基化反应。完善酶工具箱。
学习和工作经历
2020.08-2022.08 厦门大学 计算生物学 博士后
2015.09-2020.07 北京大学 理论计算化学 理学博士
2011.09-2015.07 山东大学 化学生物学 理学学士
近年发表的主要论文
1.Zhang, X.; Wang, Z.; Li, Z.; Shaik, S.; Wang, B., ACS. Catal. 2023, 13, 1173-1185.
2.Sun, D.; Wu, Z.; Zhang, X.; Yang, J.; Zhao, Y.; Nam, W.; Wang, Y., J. Am. Chem. Soc. 2023, 145, 5739-5749.
3.Peng, W.; Yan, S.; Zhang, X.; Liao, L.; Zhang, J.; Shaik, S.; Wang, B., J. Am. Chem. Soc. 2022, 144, 20484-20494.
4.Wei, J#.; Zhang, X#.; Zhou, Y.; Cheng, X.; Lin, Z.; Tang, M.; Zheng, J.; Wang, B.; Kang, Q.; Bai, L., Nat. Commun. 2022, 13, 6617
5.Wang, B.; Zhang, X.; Fang, W.; Carme. R.; Sason, S.;, Acc. Chem. Res. 2022, 55, 2280-2290
6.Chen, T#.; Zheng, Z#.; Zhang, X#.; Guo, Y.; Zhou, J.; Wang, B.; Liu, H.; Chang, W., ACS. Catal. 2022, 4, 2270-2279.
7.Zhang, X#.; Jiang, Y#.; Chen, Q#.; Dong, S.; Feng, Y.; Cong, Z.; Shaik, S.; Wang, B., ACS. Catal. 2021, 11, 8774-8785.
8.Huang, Q#.; Zhang, X#.; Chen, Q.; Tian, S.; Tong, W.; et al., ACS. Catal. 2021, 12, 265-272.
9.Zhang, X#.; Wang, Z#.; Gao, J.; Liu, W.,. Phys. Chem. Chem. Phys. 2020, 22, 8699-8712.
10.Zhang, Y.; Wei, J.; Chi, Y.; Zhang, X.; Zhang, W.-X.; Xi, Z., J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 5039-5042
11.Cao, X.-J.; Chen, L.-N.; Zhang, X.; Liu, J.-T. Miao, J.-Y.; Zhao, B.-X., Anal. Chim. Acta. 2016, 920, 86-93.
12.Zhang, X.; Jing, S.-Y.; Huang, S.-Y.; Zhou, X.-W.; Bai, J.-M.; Zhao, B.-X., Sensor. Actuat. B-chem. 2015, 206, 663-670.
13.Zhang, X.; Song, G.-J.; Cao, X.-J.; Liu, J.-T.; Chen, M.-Y.; Cao, X.-Q.; Zhao, B.-X., Rsc. Adv. 2015, 5, 89827-89832
近年主持/参与的项目
1.国家自然科学基金委员会(2024.01-2026.12) - 多尺度理论模拟方法研究非血红素酶TqaL酶调控羟基化反应、合成氮杂环丙烷结构的反应机理 - 主持
2.国家自然科学基金委员会(2019.01-2023.12) - 强关联电子体系的新方法 - 参与
3.国家自然科学基金委员会(2023.01-2026.12) - 氨基化氧掺杂氮化硼纳米片的制备及其基因递送研究 - 参与
已获授权的发明专利
略
著作编写
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学术兼职
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